長期以來空、水、廢、毒污染物排放許可證之申請，因業務不同需業者分別至不同之資訊系統或以書面進行填報及申請，造成業者需重複填寫相同基線資料，或業者疏漏未同時辦理變更或異動，造成各資訊系統間之管制資料內容不一致，因此為避免業者需重複填報相同資料及管制上的需求，環保署已進行空、水、廢、毒污染物排放許可之基線資料整合，預計自本(96)年8月1日起業者即可經由整合後之空、水、廢、毒管理資訊系統(EMS)，申請各項污染物之排放許可證及進行排放值之填報作業，可縮減業者之填報時間。
目前已列管二種污染源以上之事業(如空水、廢毒、空水廢、空水廢毒、‧‧‧列管)，請自96年8月1日起至96年9月30日止，上網至整合後之空、水、廢、毒管理資訊系統(EMS)，確認共同基線資料。若確認後之基線資料與原許可證內容不一致時，則需辦理許可證變更或異動，及依各自法規辦理變更/異動，並依照換證時程辦理換證(第一批：96年10月至11月、第二批：97年2月至年3月、第三批：97年6月至7月)，以確保基線資料之ㄧ致性。俟後各許可證變更/異動時，亦請自該資訊系統修正基線資料及辦理各許可變更/異動。本署並規劃於96年7月1日至7月31日期間，全面於各縣市辦理「空、水、廢、毒許可基線資料確認及網路申報作業說明會」，請列管二種污染源以上之事業屆時準時參加說明會。
至屬已列管之單一污染源(空、水、廢、毒單一列管)事業，若於本(96)年8月1日後有涉及許可證變更或異動時，亦請事業上網至前開整合後之空、水、廢、毒管理資訊系統(EMS) (http://ems.epa.gov.tw)辦理許可證變更或異動填報申請作業，及上網填報污染物實際排放值。另屬列管之新設事業及以後新公告列管之事業，亦皆需自本(96)年8月1日起至前開空、水、廢、毒管理資訊系統(EMS) (http://ems.epa.gov.tw)辦理許可證申請作業，及上網填報污染物實際排放值。

若有任何疑問請洽環保署事業廢棄物管制中心0800-059777免付費諮詢專線。